This (simplified) method for getGroups extracts the grouping factor
for a specified level of the random effects structure in a glmmTMB object.
# S3 method for class 'glmmTMB'
getGroups(object, form = formula(object), level, data, sep = "/", ...)a fitted glmmTMB object.
ignored (included for compatibility).
integer indicating the level of the random effects structure to extract, defaults to 1 if missing.
ignored (included for compatibility).
ignored (included for compatibility).
additional arguments (not used).
A factor representing the grouping structure at the specified level,
with a group attribute indicating the name of the grouping factor.
model <- glmmTMB(count ~ mined + (1 | spp), data = Salamanders, family = nbinom1)
getGroups(model)
#> [1] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [13] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [25] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [37] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [49] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [61] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [73] GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP GP
#> [85] GP GP GP GP GP GP GP GP PR PR PR PR
#> [97] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [109] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [121] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [133] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [145] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [157] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [169] PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR PR
#> [181] PR PR PR PR DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [193] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [205] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [217] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [229] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [241] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [253] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [265] DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM DM
#> [277] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [289] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [301] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [313] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [325] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [337] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [349] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A
#> [361] EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-A EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [373] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [385] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [397] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [409] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [421] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [433] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [445] EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L EC-L
#> [457] EC-L EC-L EC-L EC-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [469] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [481] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [493] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [505] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [517] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [529] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [541] DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L DES-L
#> [553] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [565] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [577] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [589] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [601] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [613] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [625] DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF DF
#> [637] DF DF DF DF DF DF DF DF
#> attr(,"group")
#> [1] spp
#> Levels: GP PR DM EC-A EC-L DES-L DF